馬紅球菌探針法熒光定量PCR檢測試劑盒使用方法
發(fā)表時(shí)間:2024-03-14
馬紅球菌探針法熒光定量PCR檢測試劑盒使用方法:
1. 樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1 樣本前處理
按照試劑盒操作說明或者微生物樣品處理方法做好樣品前處理。
1.2 DNA 提取
根據(jù)您實(shí)驗(yàn)室的具體情況和樣品類型,選擇適當(dāng)?shù)奶崛〔呗苑椒?。為了使?shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定、有效、可靠,我們建議使用商品化的試劑盒進(jìn)行提取,嚴(yán)格按照對(duì)應(yīng)試劑盒說明書進(jìn)行操作,樣本核酸提取過程中應(yīng)避免污染,提取好的模板樣品如不能立即檢測,建議-15℃以下保存。
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2. 試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
2.1 從-15℃以下冰箱中取出試劑盒平衡到室溫(20~25℃),注意避免強(qiáng)光照射,待完全溶解后振蕩混勻并低速離心 10 s,使用低吸附吸頭分液取樣,避免試劑損失和浪費(fèi)。
2.2 根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設(shè)所需要的 PCR 反應(yīng)管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對(duì)照+1 管陽性對(duì)照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑
鮭腎桿菌反應(yīng)液
鮭腎桿菌擴(kuò)增液
用量(樣本數(shù)為N)
19.5μL
0.5μL
2.3 在適當(dāng)容積的無菌離心管中加入上述試劑,充分振蕩混勻后 2000 rpm 離心 10 s,按照 20 μL/管分裝量將試劑分裝至八聯(lián) PCR 反應(yīng)管中。
2.4 蓋緊八聯(lián) PCR 反應(yīng)管蓋, 并注意做好相應(yīng)標(biāo)識(shí)(請(qǐng)標(biāo)記在八聯(lián) PCR 反應(yīng)管蓋兩端突出部位,切勿標(biāo)記在八聯(lián) PCR 反應(yīng)管蓋中間,以免影響信號(hào)采集)。將 PCR 反應(yīng)管轉(zhuǎn)移至樣本準(zhǔn)備區(qū),剩余試劑放回-15℃以下冰箱冷凍保存。
3. 加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1.2 提取的 DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 5μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心,核酸加樣過程中應(yīng)避免污染。
4. PCR 擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.1 將待檢測反應(yīng)管置于熒光定量 PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi), 并記錄放置順序。
4.2 設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為 25 μL;
熒光通道選擇:檢測通道選擇 FAM, 淬滅通道選擇 NONE,參比熒光選 NONE。
4.4 推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟
循環(huán)數(shù)
溫度
時(shí)間
收集熒光信號(hào)
1
1 cycle
95℃
3min
否
2
40 cycle
95℃
15sec
否
55℃
30sec
否
5. 結(jié)果分析判定
5.1 結(jié)果分析條件設(shè)定
設(shè)置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機(jī)器自動(dòng)分析的結(jié)果分析,當(dāng)曲線出現(xiàn)整體傾斜時(shí),根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動(dòng)閾值線至高于陰性對(duì)照),重新分析結(jié)果。
5.2 結(jié)果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線。
可疑:檢測通道 Ct 值>35.0,且出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線的樣本建議重復(fù)試驗(yàn),重復(fù)試驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn) Ct 值≤38.0 和典型擴(kuò)增曲線者為陽性,否則為陰性。
陰性:檢測結(jié)果 Ct 值無 Ct 值,無明顯的擴(kuò)增曲線。
6. 質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無明顯擴(kuò)增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)生長期,且 Ct 值≤30;
以上條件應(yīng)同時(shí)滿足,否則實(shí)驗(yàn)視為無效。
7. 產(chǎn)品性能指標(biāo)
陰陽性參考品符合率:5 份陽性參考品符合率為 100%;10 份陰性參考品符合率為 100%。
最低檢測限:1.0×103copies/mL。
精密度:批內(nèi)、批間精密度檢測 Ct 值的變異系數(shù)(CV)均小于等于 3%。
8. 檢測方法的局限性
樣本檢測結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān);
樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會(huì)出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
陽性對(duì)照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏,會(huì)導(dǎo)致假陽性結(jié)果;
病原體在流行過程中基因突變、重組,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
不同的提取方法存在提取效率差異,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
試劑運(yùn)輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準(zhǔn)確的結(jié)果;
本檢測結(jié)果僅供參考,如須確診請(qǐng)結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測手段。