產(chǎn)地 | |
品牌 | 帛科 |
貨號(hào) | |
用途 | |
包裝規(guī)格 | |
純度 | % |
CAS編號(hào) | |
是否進(jìn)口 |
實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程:
一、 CHO DNA 定量參考品的稀釋及標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備
用試劑盒中提供的 DNA dilution buffer 將 CHO control DNA 進(jìn)行梯度稀釋, 稀釋濃度依 次為 300pg/ul 、30pg/ul 、3pg/ul 、300fg/ul 、30fg/ul 、3fg/ul 。具體操作如下:
1.將試劑盒中的 CHO control DNA 和 DNA dilution buffer 置于冰上融化,待完全融化后,
輕微振蕩混勻,簡(jiǎn)短快速離心。
2.取 6 支干凈的 1.5ml 離心管,分別標(biāo)記為 SD1 ,SD2 ,SD3 ,SD4 ,SD5, SD6。
3,SD1 管中加入 198ul DNA dilution buffer,其余管中分別加入 180ul DNA dilution buffer。
4,取 2ul CHO control DNA 加入 SD1 管中, 然后渦旋振蕩混勻 5- 10s 后短時(shí)快速離心 5s,渦旋振蕩和快速離心各重復(fù) 3 次。
5,按表 2 依次進(jìn)行 6 次梯度稀釋操作,稀釋操作同步驟 4。
表 2. CHO control DNA 的稀釋
稀釋管 |
稀釋體積 |
濃度 |
SD1 |
2ul CHO control DNA+198ul DNA dilution buffer |
300 pg/ul |
SD2 |
20ul SD1+180ul DNA dilution buffer |
30 pg/ul |
SD3 |
20ul SD2+180ul DNA dilution buffer |
3 pg/ul |
SD4 |
20ul SD3+180ul DNA dilution buffer |
300 fg/ul |
SD5 |
20ul SD4+180ul DNA dilution buffer |
30 fg/ul |
SD6 |
20ul SD5+180ul DNA dilution buffer |
3 fg/ul |
二、加樣回收質(zhì)控 ERC 的制備
根據(jù)待測(cè)樣本的殘留量設(shè)置 ERC 中 CHO control DNA 的加樣濃度 (以制備加 45pg CHO control DNA 的樣本 ERC 為例),操作如下:
1,取待測(cè)樣本 100u,加至 1.5ml 干凈的離心管中;
2,加入 1.5ul SD2,混勻,標(biāo)記為樣本 ERC。
注:樣本 ERC 和同批待測(cè)樣本需一起進(jìn)行樣本前處理。
三、陰性質(zhì)控 NEG 的制備
根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)置陰性質(zhì)控,操作如下:
1,取 100ul 樣本基質(zhì)溶液(或洗脫液)加至 1.5ml 干凈的離心管中標(biāo)記為陰性質(zhì)控 NEG。 注:陰性質(zhì)控 NEG 樣本和同批待測(cè)樣本需一起進(jìn)行樣本前處理。
四、 qPCR 反應(yīng)液的制備和加樣
1,根據(jù)所要檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)曲線及待測(cè)樣本數(shù)量,計(jì)算所需反應(yīng)孔數(shù),一般做 3 個(gè)重復(fù)孔/樣。
反應(yīng)孔數(shù)= (6 個(gè)濃度梯度+1 個(gè)無(wú)模板對(duì)照 NTC+1 個(gè)陰性質(zhì)控 NEG+待測(cè)樣本×2) ×3 注:待測(cè)樣本×2 是為了讓每個(gè)待測(cè)樣本檢測(cè)時(shí)都同時(shí)做樣本 ERC 。 2,根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計(jì)算本次實(shí)驗(yàn)所需的各組分的所需總量以制備 pre-mix:
2×Taqman master mix=(反應(yīng)孔數(shù)+2) ×15ul (含有 2 孔的損失量)
10×CHO qPCR mix= (反應(yīng)孔數(shù)+2) ×3ul
RNase-free H2O= (反應(yīng)孔數(shù)+2) ×2ul
3,各試劑置于冰上融化,振蕩混勻,按表 3 所示進(jìn)行加樣:
表 3.各反應(yīng)孔加樣示例
標(biāo)準(zhǔn)曲線 |
20ul pre-mix+ 10ul SD1/SD2/SD3/SD4/SD5/SD6 |
NTC |
20ul pre-mix+ 10ul DNA dilution buffer |
NEG |
20ul pre-mix+ 10ul NEG |
待測(cè)樣本 |
20ul pre-mix+ 10ul 待測(cè)樣本 |
ERC 樣本 |
20ul pre-mix+ 10ul ERC 樣本 |
注:加樣完成后每孔總體積為 30ul。